Composition du Microbiote Intestinal

Le microbiote intestinal joue des rôles essentiels :

• Aide à la digestion des aliments
• Protège contre les pathogènes
• Stimule le système immunitaire
• Participe à la production de certaines vitamines

Les bactéries constituent la majorité du microbiote :

• Bactéries gram-positives : Lactobacillus, Bifidobacterium
• Bactéries gram-négatives : Escherichia coli, Bacteroides
• Bactéries anaérobies : Prevotella, Faecalibacterium

Les champignons sont minoritaires mais importants :

• Candida albicans : présent chez la majorité des individus
• Autres levures et moisissures

Les virus bactériens (bactériophages) sont nombreux :

• Bactériophages : virus qui infectent les bactéries
• Peuvent influencer la composition bactérienne

Phylum majoritaire du microbiote :

• Inclut des genres comme Clostridium, Lactobacillus, Enterococcus
• Productrices d'acides gras à chaîne courte
• Impliquées dans la fermentation des fibres

Second phylum le plus abondant :

• Genre principal : Bacteroides
• Dégradent les polysaccharides complexes
• Modulent la réponse immunitaire

Moins abondants mais importants :

• Actinobacteria (5-10%) : Bifidobacterium
• Proteobacteria (1-3%) : E. coli, Helicobacter
• Verrucomicrobia (1%) : Akkermansia muciniphila

Les Firmicutes jouent des rôles clés :

• Fermentation des fibres alimentaires non digérées
• Production d'acides gras à chaîne courte (butyrate, propionate, acétate)
• Source d'énergie pour les cellules intestinales

Les Bacteroidetes ont des fonctions spécifiques :

• Dégradation des amidons complexes
• Production de vitamines (K, B12)
• Modulation de la réponse immunitaire

Les Actinobacteria, principalement Bifidobacterium :

• Protègent contre les pathogènes
• Renforcent la barrière intestinale
• Participent au développement du système immunitaire

Candida albicans est le champignon le plus courant :

• Présent chez environ 60-70% des individus
• Habituellement inoffensif en quantité normale
• Peut causer des infections si la flore bactérienne est perturbée

Moins abondants mais présents :

• Saccharomyces : levure utilisée dans les probiotiques
• Aspergillus : champignon filamentaire
• Malassezia : présent dans certaines zones du corps

Les virus bactériens sont nombreux :

• Bactériophages : virus qui infectent les bactéries
• Peuvent contrôler la population bactérienne
• Transfèrent des gènes entre bactéries (transduction)

La génétique influence la composition :

• Le système immunitaire est en partie génétique
• Influence les récepteurs cellulaires intestinaux
• Modifie l'environnement intestinal

La composition évolue avec l'âge :

• Nouveau-né : microbiote peu diversifié
• Enfant : acquisition progressive de la flore adulte
• Adulte : microbiote stable mais changeant
• Personne âgée : baisse de la diversité

Plusieurs facteurs influencent la composition :

• Alimentation
• Hygiène de vie
• Médicaments (antibiotiques)
• Stress
• Activité physique

Les deux principaux phyla bactériens du microbiote intestinal sont :

• Firmicutes
• Bacteroidetes

Dans un microbiote équilibré, les proportions sont environ :

• Firmicutes : 60-70%
• Bacteroidetes : 20-30%

La différence observée entre les deux individus illustre la variabilité individuelle du microbiote. Même en bonne santé, les proportions peuvent varier d'une personne à l'autre, influencées par des facteurs génétiques, alimentaires, et environnementaux.

Les antibiotiques affectent la composition du microbiote parce qu'ils :

• Tuent à la fois les bactéries pathogènes et les bactéries bénéfiques
• Provoquent un déséquilibre (dysbiose) dans la flore intestinale
• Réduisent la diversité microbienne

L'augmentation de Candida albicans se produit parce que :

• Les bactéries bénéfiques qui normalement limitent sa croissance sont réduites
• Candida albicans n'est pas sensible aux antibiotiques
• Il profite de l'espace libéré par les bactéries

Le phénomène s'appelle : dysbiose ou déséquilibre du microbiote.

• Haute diversité bactérienne
• Ratio Firmicutes/Bacteroidetes équilibré
• Présence de bactéries productrices de butyrate
• Contrôle des champignons pathogènes

• Basse diversité bactérienne
• Dominance de certains groupes
• Risque d'expansion de pathogènes
• Barrière intestinale altérée

• Plus de 100 000 milliards de microorganismes
• Majoritairement des bactéries (99%)
• Moins de 1% de champignons et virus

• Firmicutes : 60-70% (productrices d'acides gras)
• Bacteroidetes : 20-30% (dégradent les polysaccharides)
• Actinobacteria : 5-10% (protègent la barrière intestinale)

• Champignons : principalement Candida albicans
• Virus : bactériophages qui régulent la flore bactérienne

• Âge
• Génétique
• Alimentation
• Médicaments (antibiotiques)
• Mode de vie