Microbiote : définition et composition
Microbiote = Bactéries + Archées + Champignons + Virus + Protistes
Environ 10¹⁴ microorganismes dans l'intestin humain
Définition: Le microbiote intestinal est l'ensemble des microorganismes (environ 100 000 milliards) vivant dans le tube digestif, principalement dans le côlon, en symbiose avec l'hôte.
Règle fondamentale: La composition du microbiote varie selon l'âge, l'alimentation, l'environnement et l'état de santé de l'individu.
Composition quantitative : 99% de bactéries, 1% autres microorganismes
Exemple de diversité :
Plus de 1000 espèces différentes de bactéries identifiées dans le microbiote humain
Quantité :
Environ 2 kg de microorganismes dans l'intestin d'un adulte
Types de microorganismes
Bactéries (99%) : Bifidobacterium, Lactobacillus, Bacteroides, Firmicutes
Archées (0.1%) : Méthanogènes comme Methanobrevibacter smithii
Champignons (0.1%) : Candida albicans, Saccharomyces
Virus (0.1%)
Protistes (0.01%) : Entamoeba, Blastocystis
Phyla bactériens dominants
Firmicutes (60-80%) : Bactéries à Gram positif
Bacteroidetes (15-30%) : Bactéries à Gram négatif
Actinobacteria (1-10%) : Bifidobacterium
Proteobacteria (<1%) : E. coli, Helicobacter
Fonctions des microorganismes
Fonctions métaboliques : Fermentation des fibres, synthèse des vitamines (K, B12), dégradation des toxines
Barrière contre les pathogènes
Communication avec le système nerveux (axe intestin-cerveau)
Stimulation du système immunitaire
Production d'acides gras à chaîne courte (butyrate)
Digestion des composés indigestibles
Régulation du métabolisme énergétique
Exemples de bactéries spécifiques
Bifidobacterium :
Produit des acides lactiques, stimule l'immunité, prévient les infections
Lactobacillus :
Produit des bactériocines, acidifie l'environnement intestinal
Faecalibacterium prausnitzii :
Productrice de butyrate, anti-inflammatoire
Facteurs influençant la composition
Composition = Génétique + Environnement + Alimentation + Mode de vie + Médicaments
Définition de la diversité microbienne: Richesse (nombre d'espèces) et équitabilité (distribution des abondances) des microorganismes présents.
Règle de la diversité: Une diversité élevée est généralement associée à une meilleure santé
Naissance par césarienne :
Moins de Bifidobacterium, plus de bactéries cutanées
Allaitement maternel :
Favorise les Bifidobacterium, oligosaccharides du lait maternel
Antibiotiques :
Réduction de la diversité, sélection de résistants
Conseils pour un microbiote sain
Consommation de fibres alimentaires
Produits fermentés (yaourts, kéfir)
Prébiotiques (inuline, FOS)
Activité physique régulière
Sommeil de qualité
Hydratation adéquate
